本病发生原因可分为两类：其一，单纯性或非感染因素;其二，感染性或可传染性疾病。前者，除生理性包茎，包皮过长，性成熟以后，包皮垢刺激或少数机械怀损伤因素而发生龟头红肿，灼热的炎症改变;后者，除非感染因素所致的包皮龟头炎均属之，亦就是病原微生物为主导因素所引起的包皮龟头炎，其中以细菌性与真菌性感染为最常见。感染性男性包皮龟头炎的病原菌除少数毒素强的细菌(如淋菌)外，大多都为非致病性微生物，或低毒细菌往往在条件具备情况下，可成致病因素，故亦称条件致病菌引起的疾病。 引起包皮龟头炎的条件致病菌中以真菌、毛滴虫或某些厌氧菌最多见，对于患包皮龟头炎的病人来说，这类致病菌来源多为外感所致，即就是性伴带菌而传给男性，遇到适宜的机体条件而发病。条件致病菌不少以女性阴道为孳生地，可因女性每月内分泌变迁，影响阴道PH条件，有利于这类寄生菌活跃繁殖，数量增多，成为发病要素，产生局部搔痒，灼热，粘膜红肿，充血，甚而可使粘膜发疹或糜烂。随之刺激阴道分泌物增多，微生物(真菌或滴虫)的产物假膜形成絮状白带，或泡沫样分泌溢出，腥臭味日渐增重。在女性阴道微生物繁殖期间，男女性交，极易成为男性被感染的机会，导致包皮龟头炎的发生。感染局部产生红肿，发疹、糜烂、渗液及灼热、发痒一系列症状。

药物过敏所引起的包皮龟炎是一种延迟型变态反应，临床上颇为常见，一般在眼药后24～72小时发病。一、急性浅表性龟头炎：多因内裤摩擦、创伤或肥皂、清洁剂局部刺激引起。表现水肿、红斑、渗出、糜烂，继发感染有脓性分泌物，易形成溃疡，自觉疼痛。二、环状糜烂性龟头炎：龟头及包皮炎症损害呈环状，或环状有乳酪状包皮垢，日久易破溃成浅溃疡，若失去环状特征则不易与浅表性龟头炎区别。本病可单独存在，也可作为Reiter综合征的粘膜症状。三、浆细胞性龟头炎：中年多见，为单个或多个经久不退的慢性炎症，损害呈斑块状，表面光滑或脱屑或湿润，浸润较明显。界清而不易破溃，表面可见似辣椒粉样细小斑点。外形难与龟头增殖性红斑区别。如类似损害发生于女阴，则称为浆细胞性外阴炎。组织病理有特异性，真皮内大量浆细胞浸润，毛细血管扩张，含铁血黄素沉着。四、云母状和角化性假上皮瘤性龟头炎：龟头损害浸润肥厚，角化过度并有云母状痂皮，患处失去正常弹性，日久萎缩。组织病理见角化过度，棘层肥厚，表皮突延长呈假性上皮瘤样增生。